计算机辅助药物设计（computer-aided drug design，CADD）是利用计算化学基本原理，通过模拟药物与受体生物大生子的相互作用或通过分析已知药物结构与活性内在关系，合理设计新型结构先导化合物的设计方法。
CADD的原理
原理：通过X－单晶衍射技等技术获得受体大分子结合部位的结构，并且采用分子模拟软件分析结合部位的结构性质，如静电场、疏水场、氢键作用位点分布等信息。然后再运用数据库搜寻或者全新药物分子设计技术，识别得到分子形状和理化性质与受体作用位点相匹配的分子，合成并测试这些分子的生物活性，经过几轮循环，即可以发现新的先导化合物。因此，计算机辅助药物设计大致包括活性位点分析法、数据库搜寻和全新药物设计。
先进性：
1、减少寻找新药的盲目性、偶然性；
2、缩短研发周期;
3、降低研发成本。
